Joe White escorte sous haute protection à Hawaii un spécialiste dans la gestion des urgences pour l'Air Force qui a été contaminé par une souche mortelle de grippe aviaire. Le convoi est alors attaqué et le patient enlevé, ce qui représente un cas de sécurité nationale. Le 5-0 n'a que très peu de temps pour empêcher les mercenaires de transformer le virus en arme…